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Besser Gene identifizieren mit GALBA

| Lesedauer: 1 Min.

Die Identifikation von Genen ist einer der ersten Schritte für die Analyse von sequenzierten DNA-Daten und somit essenziell für die moderne mikrobiologische Forschung. Als Teil eines Forschungsteams geleitet von Forschern der Universität Greifswald haben wir dazu beigetragen, dass Werkzeug GALBA basierend auf dem Werkzeug AUGUSTUS zu entwickeln. Hierzu haben wir unsere Expertise in der Softwareentwicklung im Rahmen des GAIUS Projektes genutzt, um die softwaretechnische Qualität von AUGUSTUS zu verbessern. Die hier entstandene Bibliothek pygustus ist eine wichtige Komponente von GALBA, da sie unter anderem die einfache parallele Ausführung von AUGUSTUS ermöglicht. Die vollständige Publikation inkl. der Details zu GALBA wurde in der Fachzeitschrift BMC Bioinformatics zu Veröffentlichung angenommen. Ein Preprint ist auf bioRxiv verfügbar.

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